تحلیل خانواده‌های ژنی در ریزآرایه لنفوبلاستیک حاد

Authors

  • خداکریم, سهیلا 1- دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، دانشکده بهداشت، گروه اپیدمیولوژی
  • دهقان نیری , نسرین 4- دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، دانشکده پیراپزشکی، گروه انفورماتیک پزشکی
  • رضایی طاویرانی, مصطفی 3- دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، دانشکده پیراپزشکی، مرکز تحقیقات پروتئومیکس
  • زایری, فرید 3- دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، دانشکده پیراپزشکی، مرکز تحقیقات پروتئومیکس
  • طباطبایی, سید محمد 4- دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، دانشکده پیراپزشکی، گروه انفورماتیک پزشکی
  • علوی مجد, حمید 2- دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، دانشکده پیراپزشکی، گروه آمار زیستی
Abstract:

  سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده‌های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده‌های ژنی که بین فنوتیپ‌های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می‌کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن‌های منفرد، تحلیل خانواده‌های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن‌ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ‌ها به کار می‌گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده‌های ژنی پرداخته می‌شود. مواد و روش‌ها: از دو روش طبقه‌ای و فراموضعی، برای شناسایی خانواده‌های ژنی با بیان متفاوت به عنوان عامل افتراق بین افراد سالم و بیمار (فنوتیپ) مبتلا به لنفوبلاستیک حاد که دارای کروموزوم BCR/ABL هستند، استفاده شد. در این مطالعه، داده‌های ریزآرایه‌ی یک کارآزمایی بالینی لوسمی لنفوبلاستیک حاد مورد استفاده قرار گرفته و برای تحلیل داده‌ها از نرم‌افزار R استفاده گردید. یافته‌ها: از 200 خانواده ژنی بررسی شده، روش فراموضعی 114 خانواده را که بین جمعیت سالم و بیمار بیان متفاوتی داشتند، شناسایی کرد. در حالی‌که روش طبقه‌ای تنها موفق به شناسایی 30 خانواده ژنی با بیان متفاوت گردید.  نتیجه‌گیری: در هر یک از دو مجموعه خانواده‌های ژنی شناسایی شده به‌وسیله هر روش، تعدادی خانواده‌ی ژنی موثر در بیماری لوسمی لنفوبلاستیک حاد دیده می‌شود. بنابراین، اگر چه معرفی روش تحلیلی با توان تشخیصی بالاتر بین افراد سالم و بیمار مبتلا به لنفوبلاستیک حاد، نیازمند به مطالعه‌ای دقیق‌تر است، اما بررسی خانواده‌های ژنی مشترک بین دو روش منجر گردید، آخرین یافته‌های بیولوژیست‌ها تنها با استفاده از این روش‌های آماری به دست آید.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

تحلیل خانواده های ژنی در ریزآرایه لنفوبلاستیک حاد

سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده های ژنی که بین فنوتیپ های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن های منفرد، تحلیل خانواده های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ ها به کار می گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده های ژنی پرداخته می شود. مواد و روش ها: از دو روش ط...

full text

اثر مهارگر اختصاصی p110 در سلول‌های لوسمی لنفوبلاستیک حاد

چکیده سابقه و هدف اختلال در مسیر PI3K در لوسمی لنفوبلاستیک حاد(ALL) همراه با نقش مهم آن در ایجاد مقاومت به داروهای شیمی درمانی، باعث شده است که استفاده از مهارگران PI3K در درمان ALL اهمیت به سزایی پیدا کند. بر این اساس، بر آن شدیم تا اثر مهارگر اختصاصی ایزوفرم p110δ (GS-1101) را در سلول­های لوسمی لنفوبلاستیک حاد Nalm-6 بررسی کنیم. مواد و روش‌ها در یک مطالعه تجربی، به­ منظور بررسی اثرات سایتوتو...

full text

یک مدل بازی مشارکتی برای تحلیل داده های بیان ژنی آزمایش ریزآرایه

فناوری ریزآرایه یک ابزار تحلیلی کوچک است که به کمک آن می توان بیان ده ها هزار ژن را، به طور همزمان مورد کاوش قرار داد. سوال عمده مورد بحث در ریزآرایه ها، چگونگی انتخاب مارکرهای ژنی می باشد، تشخیص مارکرهای ژنی می تواند تشخیص زودتر، درمان و پیش بینی دقیق تر نتیجه بیماری ومتعاقب آن استفاده از درمان های مناسب وکاهش هزینه ها را در پی داشته باشد.با استفاده از نظریه های آماری برای پردازش داده های ریزآ...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 14  issue 4

pages  414- 421

publication date 2013-06

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023